黃棣棟主任在小兒神經外科的專業上有豐富的學經歷，受到國內外名師的培訓，成為全職的兒童神經外科的專業醫師。三十多年的行醫，黃教授研習各式兒童神經外科手術， 是國內兒童神經外科的開拓領導者，同時也是全臺收治最多兒童腦瘤病例的醫師（1,500例）。臨床上，黃棣棟也專精兒童腦性麻痺、兒童水腦症內視鏡手術，尤其是兒童 水腦症內視鏡手術，只能在患者頭部開一個約一毫米傷口，將器械置入執行，手術困難度高，但黃棣棟已完成約兩百例，且無失敗紀錄。
黃教授不僅是國內兒童神經外科手術界的翹楚，其卓越的成就更早已揚名國際。他曾先後加入並活躍於國內外重要的兒童神經外科學會，2007年更被「國際兒童神經外科 醫學會」 ﹙ISPN﹚選為2008～2009年學會主席，這是全球兒童神經外科界的最高榮譽，也第一位華人學會主席。
黃主任曾說，會投身兒童神經外科這個不算熱門的領域，是因自己愛孩子與外科，當看到孩子恢復健康，他再辛苦都沒關係，像超商不歇息的黃主任更是家屬的精神支柱， 曾有病童媽媽因擔心兒子病情，直接衝到黃主任的辦公室詢問，黃主任馬上放下手邊工作，為她解析兒子的病情、化解她的不安，對病人需求隨傳隨到，關懷備至。卸任後的 黃主任目前轉往台北醫學大學繼續發揮他的專長，當腦病兒童的守護神，感謝黃主任提升本部在神經外科的醫療專業，提供腦瘤病童更精良的醫療服務，他的貢獻令人難忘。